El Mundo, una misteriosa entidad multinacional, reúne a doce espers con poderes especiales en una aeronave flotante.

Puede que la historia compartida de estos jóvenes haya llegado a su fin, pero cada uno está por vivir su propia aventura.

Pasado, presente y futuro convergen en los tres modos de historia de Norn9: Last Era, que incluyen una mirada al pasado de los personajes antes de que vivieran juntos en la aeronave; nuevas versiones de los eventos de Norn9: Var Commons, narrados desde otros puntos de vista, e historias que transcurren después de los acontecimientos del primer juego.